Predmetom ochrany CITES je približne 6 000 druhov živočíchov a 32 000 druhov rastlín. Zo živočíchov sú v CITES zaradené napr. slony, nosorožce, opice, mačkovité šelmy (tiger, lev, leopard, puma), krokodíly, korytnačky, leguány, chameleóny, veľhady, jašterice,papagáje, pavúky, motýle.
Z našich pôvodných druhov živočíchov sú do CITES zaradené napr.
- medveď hnedý,
- vlk dravý,
- rys ostrovid,
- mačka lesná,
- vydra riečna,
- dravé vtáky – orly,sokoly, jastraby, sovy,
- drop fúzatý,
- motýľ – jasoň červenooký.